एक समय में जावन गैंडे पूरे दक्षिण-पूर्व एशिया में पाए जाते थे, लेकिन इनके शिकार और निवास स्थान के नुकसान के कारण इनकी संख्या को भारी गिरावट का सामना करना पड़ा है। जावन गैंडों की अकेली जंगली आबादी गैंडों की दुर्लभ प्रजातियों - लगभग 75प्रजातियां - में से एक है, जो केवल जावा, इंडोनेशिया के द्वीप पर पाई जाती हैं। उजंग कुलोन नेशनल पार्क (Ujung Kulon National Park), एक विश्व धरोहर स्थल, जावन गैंडों की अंतिम शेष शरण स्थल है। लेकिन यह क्षेत्र हमलावर अरेंगा ताड़ से भी ग्रस्त है, जिससे गैंडों को खाने के लिए कम भोजन और घूमने के लिए कम निवास स्थान मिलता है। इसके अलावा, छोटे जावन गैंडों की आबादी भी प्राकृतिक आपदाओं, बीमारी, अवैध शिकार और संभावित अंतःप्रजनन के कारण विलुप्त होने की चपेट में है।